树体内各种内源激素合成于不同器官，如生长素(IAA)合成于茎尖及幼嫩部分，赤霉素(GA)在各幼嫩器官合成。
细胞分裂素(CTK)主要合成于根尖，而脱落酸和乙烯主要在树体内的成熟器官形成。修剪改变了这些器官的数量及比例，调节了个别器官的生理活性，这样就直接或间接改变了激素的合成、运转及平衡等关系。
修剪作用的内因，很大程度上是依靠内源激素的变化实现的，这也是树木进行化学修剪的理论基础，使用人工合成的植物生长调节剂，改变树体内原来的激素平衡，控制树木生长发育，进而达到修剪的目的。
激素和营养物质的运转与极性有密切关系。修剪能改变极性生长。只有在幼嫩的部分，生活力高的活细胞中才能不断地产生代谢活动所需要的激素，激素沿着活细胞进行纵向极性运输，在有光条件下运输活跃，在黑暗中则运输能力下降。
因此，修剪改变了极性生长，也就改变了激素的平衡;修剪改变了光照条件，从而促进激素极性运转机能的活化。
短截剪去了枝条的先端部分，排除了高浓度生长素对下面侧芽的抑制作用，可提高下部侧芽的萌芽力和成枝力；
休眠时期如果在芽的上方进行刻伤，则切断了顶端激素向下运输的通路，因而可刺激下部芽的萌发发;修剪中常常采用压低枝条、开张角度或曲枝等方法，影响激素的分布，使其向有利于有机物质合成和积累的方向转化。
从上面介绍来看，修剪的实质是调节营养养及激素的运转与分配，本身不能提供养分和水分。
因而修剪不能代替土、肥、水等管理，只能和这些措施相配合，减少和克服不必要的消耗和浪费。在进行修剪时，必须根据树体内的营养状况进行，才能获得良好效果。
